Mathieu Lupien, PhD; FRSC

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Myles BrownEmil Frei III Professor of Medicine, Dana-Farber Cancer Institute and Harvard Medical SchoolBestätigte E-Mail-Adresse bei dfci.harvard.edu
Swneke D. BaileyAssistant Professor at McGill UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei mcgill.ca
Benjamin Haibe-KainsScientist (Principal Investigator), Princess Margaret Cancer Centre, University Health NetworkBestätigte E-Mail-Adresse bei uhnresearch.ca
Dr. Stanley Zhou, PhDArsenal Biosciences Inc. (Previously: Princess Margaret Cancer Centre)Bestätigte E-Mail-Adresse bei mail.utoronto.ca
Xiaole Shirley LiuCEO, GV20 TherapeuticsBestätigte E-Mail-Adresse bei ds.dfci.harvard.edu
Cliff MeyerDana-Farber Cancer Institute and Harvard T.H. Chan School of Public HealthBestätigte E-Mail-Adresse bei jimmy.harvard.edu
John E. DickUniversity of TorontoBestätigte E-Mail-Adresse bei uhnresearch.ca
Ken KronUniversity Health NetworkBestätigte E-Mail-Adresse bei uhnresearch.ca
Jason CarrollUniversity of CambridgeBestätigte E-Mail-Adresse bei cruk.cam.ac.uk
Luca MagnaniBreast Epigenetic Plasticity and Evolution Lab, Institute of Cancer ResearchBestätigte E-Mail-Adresse bei icr.ac.uk
Xiaoyang ZhangHuntsman Cancer InstituteBestätigte E-Mail-Adresse bei hci.utah.edu
Jason H. MooreChair, Department of Computational Biomedicine, Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, CABestätigte E-Mail-Adresse bei csmc.edu
Cheryl ArrowsmithSenior Scientist, Princess Margaret Cancer Centre & Professor of Medical Biophysics, University of TorontoBestätigte E-Mail-Adresse bei uhnres.utoronto.ca
Housheng Hansen HePrincess Margaret Cancer Centre, University Health Network; Department of Medical BiophysicsBestätigte E-Mail-Adresse bei uhnresearch.ca
David W. CesconMedical Oncologist and Clinician Scientist, Princess Margaret Cancer Centre, University of TorontoBestätigte E-Mail-Adresse bei uhn.ca
Paul C. BoutrosUniversity of California, Los AngelesBestätigte E-Mail-Adresse bei mednet.ucla.edu
Peter ScacheriProfessor, Case Western Reserve UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei case.edu
Seyed Ali Madani TonekaboniStaff Machine Learning Scientist (Recursion Pharmaceutical)Bestätigte E-Mail-Adresse bei recursionpharma.com
Van der Kwast TUniversity Health NetworkBestätigte E-Mail-Adresse bei uhn.ca
Olivia CorradinWhitehead Institute for Biomedical ResearchBestätigte E-Mail-Adresse bei wi.mit.edu

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Mathieu Lupien, PhD; FRSC

Senior Scientist/Professor, Princess Margaret Cancer Centre

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chromatin epigenomic genomic cancer transcription


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FoxA1 translates epigenetic signatures into enhancer-driven lineage-specific transcription M Lupien, J Eeckhoute, CA Meyer, Q Wang, Y Zhang, W Li, JS Carroll, ... Cell 132 (6), 958-970, 2008	1136	2008
Androgen receptor regulates a distinct transcription program in androgen-independent prostate cancer Q Wang, W Li, Y Zhang, X Yuan, K Xu, J Yu, Z Chen, R Beroukhim, ... Cell 138 (2), 245-256, 2009	1083	2009
Epigenomic alterations define lethal CIMP-positive ependymomas of infancy SC Mack, H Witt, RM Piro, L Gu, S Zuyderduyn, AM Stütz, X Wang, ... Nature 506 (7489), 445-450, 2014	663	2014
Genomic hallmarks of localized, non-indolent prostate cancer M Fraser, VY Sabelnykova, TN Yamaguchi, LE Heisler, J Livingstone, ... Nature 541 (7637), 359-364, 2017	633	2017
Nucleosome dynamics define transcriptional enhancers HH He, CA Meyer, H Shin, ST Bailey, G Wei, Q Wang, Y Zhang, K Xu, ... Nature genetics 42 (4), 343-347, 2010	561	2010
Fate mapping of human glioblastoma reveals an invariant stem cell hierarchy X Lan, DJ Jörg, FMG Cavalli, LM Richards, LV Nguyen, RJ Vanner, ... Nature 549 (7671), 227-232, 2017	459	2017
Positive cross-regulatory loop ties GATA-3 to estrogen receptor α expression in breast cancer J Eeckhoute, EK Keeton, M Lupien, SA Krum, JS Carroll, M Brown Cancer research 67 (13), 6477-6483, 2007	420	2007
Estrogen-dependent signaling in a molecularly distinct subclass of aggressive prostate cancer SR Setlur, KD Mertz, Y Hoshida, F Demichelis, M Lupien, S Perner, ... Journal of the National Cancer Institute 100 (11), 815-825, 2008	396	2008
Combinatorial effects of multiple enhancer variants in linkage disequilibrium dictate levels of gene expression to confer susceptibility to common traits O Corradin, A Saiakhova, B Akhtar-Zaidi, L Myeroff, J Willis, ... Genome research 24 (1), 1-13, 2014	393	2014
Epigenomic enhancer profiling defines a signature of colon cancer B Akhtar-Zaidi, R Cowper-Sal· lari, O Corradin, A Saiakhova, CF Bartels, ... Science 336 (6082), 736-739, 2012	379	2012
Breast cancer risk–associated SNPs modulate the affinity of chromatin for FOXA1 and alter gene expression R Cowper-Sal· lari, X Zhang, JB Wright, SD Bailey, MD Cole, J Eeckhoute, ... Nature genetics 44 (11), 1191-1198, 2012	338	2012
A Myc enhancer cluster regulates normal and leukaemic haematopoietic stem cell hierarchies C Bahr, L Von Paleske, VV Uslu, S Remeseiro, N Takayama, SW Ng, ... Nature 553 (7689), 515-520, 2018	311	2018
Risk SNP-mediated promoter-enhancer switching drives prostate cancer through lncRNA PCAT19 JT Hua, M Ahmed, H Guo, Y Zhang, S Chen, F Soares, J Lu, S Zhou, ... Cell 174 (3), 564-575. e18, 2018	307	2018
Functional enhancers shape extrachromosomal oncogene amplifications AR Morton, N Dogan-Artun, ZJ Faber, G MacLeod, CF Bartels, MS Piazza, ... Cell 179 (6), 1330-1341. e13, 2019	280	2019
Intratumor DNA methylation heterogeneity reflects clonal evolution in aggressive prostate cancer D Brocks, Y Assenov, S Minner, O Bogatyrova, R Simon, C Koop, ... Cell reports 8 (3), 798-806, 2014	279	2014
PharmacoGx: an R package for analysis of large pharmacogenomic datasets P Smirnov, Z Safikhani, N El-Hachem, D Wang, A She, C Olsen, ... Bioinformatics 32 (8), 1244-1246, 2016	277	2016
Epigenetic switch involved in activation of pioneer factor FOXA1-dependent enhancers AA Sérandour, S Avner, F Percevault, F Demay, M Bizot, ... Genome research 21 (4), 555-565, 2011	275	2011
Integrated (epi)-genomic analyses identify subgroup-specific therapeutic targets in CNS rhabdoid tumors J Torchia, B Golbourn, S Feng, KC Ho, P Sin-Chan, A Vasiljevic, ... Cancer cell 30 (6), 891-908, 2016	249	2016
CARM1 regulates estrogen-stimulated breast cancer growth through up-regulation of E2F1 S Frietze, M Lupien, PA Silver, M Brown Cancer research 68 (1), 301-306, 2008	248	2008
Modulation of long noncoding RNAs by risk SNPs underlying genetic predispositions to prostate cancer H Guo, M Ahmed, F Zhang, CQ Yao, SD Li, Y Liang, J Hua, F Soares, ... Nature genetics 48 (10), 1142-1150, 2016	236	2016

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